Malaysia berhasil menggeser Thailand yang menjadi juara umum 2015 di Singapura.
Sementara itu Indonesia berada di urutan ke lima dengan 38 emas, 63 perak dan 90 perunggu. Indonesia berada di bawah posisi Malaysia, Thailand, Vietnam dan Singapura. Posisi Indonesia tidak berubah dari SEA Games 2015.
| No | Negara | Emas | Perak | Perunggu | Jumlah |
| 1 | Malaysia | 145 | 92 | 86 | 323 |
| 2 | Thailand | 72 | 86 | 88 | 246 |
| 3 | Vietnam | 58 | 50 | 60 | 168 |
| 4 | Singapura | 57 | 58 | 73 | 188 |
| 5 | Indonesia | 38 | 63 | 90 | 191 |
| 6 | Filipina | 24 | 33 | 64 | 121 |
| 7 | Myanmar | 7 | 10 | 20 | 37 |
| 8 | Kamboja | 3 | 2 | 12 | 17 |
| 9 | Laos | 2 | 3 | 21 | 26 |
| 10 | Brunei | 0 | 5 | 9 | 14 |
| 11 | Timor Leste | 0 | 0 | 3 | 3 |
